В отделении выполняются диагностические и лечебные эзофагогастродуоденоскопии, ректосигмоколоносопии в амбулаторных и стационарных условиях.
Особое внимание уделяется диагностике рака желудочно-кишечного тракта на ранних стадиях у пациентов из группы риска. Для этого им проводятся эндоскопические исследования с окраской слизистой, проведением пункционной биопсии и расширенной резекции слизистой для уточнения диагноза.
Особенно большой опыт врачи отделения имеют в проведении колоноскопии и удалении доброкачественных опухолей толстой и прямой кишки.
Заведующий эндоскопическим отделением - Лавров Дмитрий Борисович.